Unity tiene sistemas de física separados para 2D y 3D.

No se mezclan.

3D

Clases típicas:

Rigidbody
Collider
BoxCollider
SphereCollider
Physics
Collision

Eventos:

OnCollisionEnter
OnTriggerEnter

2D

Clases típicas:

Rigidbody2D
Collider2D
BoxCollider2D
CircleCollider2D
Physics2D
Collision2D

Eventos:

OnCollisionEnter2D
OnTriggerEnter2D

Error común

Esto no funciona entre sí:

Rigidbody2D + BoxCollider 3D

Ni:

Rigidbody 3D + BoxCollider2D